[哪个查基因更准确一些啊]如何快速查找物种间对应的同源基因

 admin   2022-09-13 15:36   87 人阅读  0 条评论

他们晓得小鼠是两个科学研究许多的模式生物,有许多生物化学科学研究,和许多临床科学研究都是在小鼠上做的。所以小鼠里头科学研究的那个DNA在人里头是不是,相关联的具体内容又是两个甚么DNA,这是他们时常须要遭遇的两个难题。

那时小贴士就来跟我们深入探讨呵呵怎样加速搜寻亚种间相关联的相混DNA。这儿给我们如是说三种方式。他们以人和小鼠间的相混DNA总括,其它亚种依序以此类推。

方式一、间接搜寻NCBI的homologene

他们以TP53那个DNA为例,在搜索框中输出须要搜寻的DNA英文名字,这他们搜人的TP53在其它亚种里头的相混DNA

点选search后会获得下面这姚学甲,你会找出TP53在小鼠,小鼠和其它许多亚种里头的相混DNA的英文名字

方式二、采用R包homologene

下面提及的方式仅全力支持极少数DNA的索引,假如你手里有成千上万个DNA须要搜寻相混DNA,或许两个两个去查就不现实生活了。下面他们用R标识符来大批量做

他们能获得如下表所示结论,前面一列相关联的是Entrez gene ID

有人可能会问,我怎么晓得每个亚种的亚种号是多少?别急,那个包有个函数能输出全力支持的亚种号列表

是不是很贴心,基本上常见的许多亚种都是全力支持的

对于像小鼠和人这种时常用的亚种,甚至拥有自己的函数

会获得相同的结论,都不须要晓得亚种号了

反之亦然

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